LAVORI PAGATI DIETRO PRESENTAZIONE DI FATTURA (art. 161 DPR 554/1999)

Salve, mi trovo a chiudere la contabilità di un cantiere di restauro in cui abbiamo dovuto far ricorso a delle lavorazioni extracontrattuali pagate all'Appaltatore dietro presentazione di fattura, previa acquisizione di un preventivo che il RUP ha approvato. Dovendo compilare il registro di contabilità e il conto finale, essendo il lavoro extracontrattuale, esso è comunque soggetto a ribasso (come lo sono quelli in economia, ad esempio)? La lavorazione va annotata nel registro di contabilità oppure, essendo extracontrattuale, va semplicemente riportato nella relazione del conto finale che tot euri del fondo imprevisti sono stati spesi per quietanzare tale fattura? Spero che qualcuno possa chiarirmi questi dubbi....Grazie.