Lavori in immobile extraterritoriale

Salve a tutti,
vi scrivo perchè mi è capitato un lavoro che non ho mai affrontato prima. Un cliente ha preso in affitto un locale in centro a Roma per farne un negozio di abbigliamento. Il negozio risulta essere extraterritoriale (dice che anche il contratto di affitto è stato registrato in Vaticano anzichè all'Agenzia delle Entrate). Per quanto riguarda la SCIA amministrativa c'è l'apposita spunta sul modulo del Comune ed ho risolto così. Per quanto riguarda la regolarità delle opere edili devo fare qualcosa? Se va fatto qualcosa la devo fare al Municipio di competenza o al Vaticano. Non sono ancora andato a parlare all'U.T.O. perchè grazie al sistema TUPASSI il prossimo appuntamento Municipio 1 è tra circa un mese.. Grazie