Variante a sanatoria?

Sono alle prese con il certificato di agibilità di una casa in montagna (100mq).
Ho fatto un po di casino! Di seguito i (mis)fatti.

Ho ottenuto il permesso di costruire nel 96 ed ho completato i lavori nel 99.
Mi sono disinteressato per qualche tempo e, finalmente, nel 2002, dopo aver seguito l'iter giusto, ho depositato il "certificato di collaudo statico".
Non ho accatastato l'immobile, non ho fatto l'ultimazione lavori né l'agibilità.

In compenso nel 2003 ho fatto, purtroppo, un patio (3x3) in cls collegato alla struttura della casa (solaio e fondazione) ricavando un ampliamento della zona interrata di cui è provvisto l'immobile, senza alcuna comunicazione al Comune.
Il disastro è stato quando ho accatastato, nel 2007, il tutto per come è realmente (ovvio).
Ora mi ritrovo con una difformità della struttura rispetto al progetto originale e, quindi, dell’impossibilità di produrre il certificato di collaudo statico e di fare l’ultimazione lavori; il tutto ai fini dell’agibilità.

Credo che non mi resti che chiedere una variante a sanatoria per lavori eseguiti.
Mi chiedo:
- devo ripresentare i calcoli in revisione al Genio Civile?
- come faccio ad integrare il certificato di collaudo statico con la nuova struttura (non ho provini, ecc.)?

C’è una strada diversa (che non sia la demolizione)?

AIUTO!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!