LUCERNARI

Buongiorno a tutti,
ho un immobile sito in nucleo storico per cui è stato presentato permesso di costruire (con il solo esame di impatto paesistico) per la ristrutturazione completa. Le opere prevedevano il rifacimento del tetto, su cui era stata approvata la realizzazione di due lucernari. In corso d'opera si è deciso di non realizzarli quindi il tetto è stato rifatto esattamente come l'originale. Qualcuno sa dirmi se presentando una variante in corso d'opera (il cantiere è ancora aperto) rischio sanzione per non aver preventivamente chiesto parere favorevole?
Ringrazio per le gentili risposte